MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	T	6	6	47	52	0 %	100 %	0 %	0 %	409250028
2	NT_187101	GCAAG	2	10	86	95	40 %	0 %	40 %	20 %	409250028
3	NT_187101	CCAGCG	2	12	236	247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250028
4	NT_187101	CGG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
5	NT_187101	CCT	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250028
6	NT_187101	GC	3	6	443	448	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
7	NT_187101	CAT	3	9	483	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
8	NT_187101	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
9	NT_187101	GCC	2	6	579	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
10	NT_187101	CCAGAA	2	12	608	619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250028
11	NT_187101	CGC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
12	NT_187101	GATT	2	8	705	712	25 %	50 %	25 %	0 %	409250028
13	NT_187101	GCG	2	6	784	789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
14	NT_187101	CCG	2	6	845	850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
15	NT_187101	CG	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
16	NT_187101	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
17	NT_187101	CCG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
18	NT_187101	CAG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
19	NT_187101	CAC	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250028
20	NT_187101	GCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
21	NT_187101	TAA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
22	NT_187101	TGC	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
23	NT_187101	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
24	NT_187101	TCT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
25	NT_187101	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
26	NT_187101	GCA	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
27	NT_187101	CTGG	2	8	1417	1424	0 %	25 %	50 %	25 %	409250028
28	NT_187101	GGC	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
29	NT_187101	GTG	2	6	1567	1572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
30	NT_187101	TCCG	2	8	1587	1594	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
31	NT_187101	GGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
32	NT_187101	CGGCG	2	10	1668	1677	0 %	0 %	60 %	40 %	409250028
33	NT_187101	GAC	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
34	NT_187101	CGG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
35	NT_187101	GC	3	6	1700	1705	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
36	NT_187101	TGCC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
37	NT_187101	TGC	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
38	NT_187101	GAA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
39	NT_187101	GAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
40	NT_187101	CGC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
41	NT_187101	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
42	NT_187101	TCG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
43	NT_187101	CCG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
44	NT_187101	TAAG	2	8	2136	2143	50 %	25 %	25 %	0 %	409250028
45	NT_187101	T	6	6	2199	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	409250028
46	NT_187101	ATT	2	6	2265	2270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
47	NT_187101	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
48	NT_187101	CG	3	6	2418	2423	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
49	NT_187101	ACGC	2	8	2449	2456	25 %	0 %	25 %	50 %	409250028
50	NT_187101	GAT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
51	NT_187101	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
52	NT_187101	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
53	NT_187101	TCA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
54	NT_187101	GC	3	6	2582	2587	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
55	NT_187101	CAT	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
56	NT_187101	ATG	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
57	NT_187101	ATA	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
58	NT_187101	GC	3	6	2966	2971	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
59	NT_187101	TTG	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
60	NT_187101	A	7	7	3075	3081	100 %	0 %	0 %	0 %	409250028
61	NT_187101	TG	3	6	3116	3121	0 %	50 %	50 %	0 %	409250028
62	NT_187101	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
63	NT_187101	GT	3	6	3231	3236	0 %	50 %	50 %	0 %	409250028
64	NT_187101	GC	3	6	3246	3251	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
65	NT_187101	ATC	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
66	NT_187101	AGC	3	9	3313	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
67	NT_187101	GAT	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
68	NT_187101	CGG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
69	NT_187101	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
70	NT_187101	TTG	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
71	NT_187101	A	6	6	3729	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	409250029
72	NT_187101	GC	3	6	3766	3771	0 %	0 %	50 %	50 %	409250029
73	NT_187101	CTG	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250029
74	NT_187101	TAT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250029
75	NT_187101	GC	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	409250030
76	NT_187101	TGGG	2	8	3866	3873	0 %	25 %	75 %	0 %	409250030
77	NT_187101	TTA	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250030
78	NT_187101	CAG	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250030
79	NT_187101	GCG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250030
80	NT_187101	GCGAA	2	10	3975	3984	40 %	0 %	40 %	20 %	409250030
81	NT_187101	GC	3	6	4050	4055	0 %	0 %	50 %	50 %	409250030
82	NT_187101	GCC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250030
83	NT_187101	GTT	2	6	4195	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250031
84	NT_187101	CAT	2	6	4308	4313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250031
85	NT_187101	ATTG	2	8	4376	4383	25 %	50 %	25 %	0 %	409250031
86	NT_187101	GGT	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250031
87	NT_187101	CA	3	6	4518	4523	50 %	0 %	0 %	50 %	409250031
88	NT_187101	ATG	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250031
89	NT_187101	TTC	2	6	4564	4569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250031
90	NT_187101	CGG	2	6	4824	4829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
91	NT_187101	CAT	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
92	NT_187101	CGTT	2	8	4881	4888	0 %	50 %	25 %	25 %	409250032
93	NT_187101	CATC	2	8	4897	4904	25 %	25 %	0 %	50 %	409250032
94	NT_187101	TTC	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250032
95	NT_187101	GCC	2	6	4944	4949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250032
96	NT_187101	AATC	2	8	4954	4961	50 %	25 %	0 %	25 %	409250032
97	NT_187101	GC	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	409250032
98	NT_187101	AAC	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250032
99	NT_187101	GCG	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
100	NT_187101	GCG	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
101	NT_187101	CGG	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
102	NT_187101	TCA	3	9	5329	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
103	NT_187101	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250032
104	NT_187101	ATT	2	6	5429	5434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250032
105	NT_187101	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	409250032
106	NT_187101	CGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250032
107	NT_187101	CAG	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250032
108	NT_187101	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	409250032
109	NT_187101	GCC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
110	NT_187101	CTG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
111	NT_187101	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
112	NT_187101	GTTG	2	8	6188	6195	0 %	50 %	50 %	0 %	409250033
113	NT_187101	CTGC	2	8	6241	6248	0 %	25 %	25 %	50 %	409250033
114	NT_187101	CGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
115	NT_187101	TGC	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
116	NT_187101	CAG	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250033
117	NT_187101	CGC	2	6	6477	6482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
118	NT_187101	TGG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
119	NT_187101	GCCGG	2	10	6799	6808	0 %	0 %	60 %	40 %	409250033
120	NT_187101	CG	3	6	7046	7051	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
121	NT_187101	TGAT	2	8	7058	7065	25 %	50 %	25 %	0 %	409250033
122	NT_187101	TGA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
123	NT_187101	GGCG	2	8	7098	7105	0 %	0 %	75 %	25 %	409250033
124	NT_187101	CGC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
125	NT_187101	GCG	2	6	7121	7126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
126	NT_187101	TTC	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250033
127	NT_187101	GC	3	6	7275	7280	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
128	NT_187101	GC	3	6	7454	7459	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
129	NT_187101	TGC	2	6	7502	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
130	NT_187101	CGGG	2	8	7576	7583	0 %	0 %	75 %	25 %	409250033
131	NT_187101	TGG	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
132	NT_187101	CCA	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250033
133	NT_187101	CCG	2	6	7745	7750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
134	NT_187101	CAGGGG	2	12	7753	7764	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	409250033
135	NT_187101	GGC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
136	NT_187101	CG	3	6	7886	7891	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
137	NT_187101	GCA	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250033
138	NT_187101	GCG	2	6	8159	8164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
139	NT_187101	TGGC	2	8	8208	8215	0 %	25 %	50 %	25 %	409250033
140	NT_187101	GGT	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
141	NT_187101	GGC	2	6	8382	8387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
142	NT_187101	GAA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250033
143	NT_187101	CCT	2	6	8536	8541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250033
144	NT_187101	ATAA	2	8	8567	8574	75 %	25 %	0 %	0 %	409250033
145	NT_187101	GTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250034
146	NT_187101	CGC	2	6	8648	8653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250034
147	NT_187101	GAA	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250034
148	NT_187101	TG	3	6	8826	8831	0 %	50 %	50 %	0 %	409250035
149	NT_187101	GC	3	6	8851	8856	0 %	0 %	50 %	50 %	409250035
150	NT_187101	TGG	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250035
151	NT_187101	ATG	2	6	8909	8914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250035
152	NT_187101	CGC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250035
153	NT_187101	CAG	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250035
154	NT_187101	ATC	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250035
155	NT_187101	GC	3	6	9039	9044	0 %	0 %	50 %	50 %	409250035
156	NT_187101	CTG	2	6	9258	9263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250036
157	NT_187101	CGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250036
158	NT_187101	GCAGTG	2	12	9359	9370	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250036
159	NT_187101	T	6	6	9454	9459	0 %	100 %	0 %	0 %	409250036
160	NT_187101	AT	3	6	9476	9481	50 %	50 %	0 %	0 %	409250036
161	NT_187101	TCA	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250036
162	NT_187101	ATG	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250036
163	NT_187101	GGC	2	6	9605	9610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250036
164	NT_187101	GCG	2	6	9615	9620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250036
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167	NT_187101	CCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250037
168	NT_187101	GA	3	6	9875	9880	50 %	0 %	50 %	0 %	409250037
169	NT_187101	ACC	2	6	9881	9886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250037
170	NT_187101	AGT	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250037
171	NT_187101	CGT	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250037
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177	NT_187101	AGTC	2	8	10221	10228	25 %	25 %	25 %	25 %	409250037
178	NT_187101	TGC	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250038
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250	NT_187101	GAC	2	6	13970	13975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250038
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252	NT_187101	CAG	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250038
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260	NT_187101	AAC	2	6	14551	14556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250039
261	NT_187101	TCG	2	6	14562	14567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250039
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264	NT_187101	GCG	2	6	14833	14838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250039
265	NT_187101	GAAA	2	8	14876	14883	75 %	0 %	25 %	0 %	409250039
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379	NT_187101	TAT	2	6	22143	22148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250047
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388	NT_187101	AT	3	6	23563	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	409250049
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391	NT_187101	A	6	6	23642	23647	100 %	0 %	0 %	0 %	409250049
392	NT_187101	GAT	2	6	23714	23719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250049
393	NT_187101	GGC	3	9	23756	23764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250049
394	NT_187101	CGG	2	6	23832	23837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250049
395	NT_187101	GCG	2	6	23841	23846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250049
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